1. 試劑配制區（試劑儲存和準備區）：用于擴增試劑的配制、分裝和保存。此區域應保持微正壓，以防外界含核酸氣溶膠的空氣進入造成污染。面積通常在15~20平方米左右。

2. 樣品處理區（標本制備區）：用于樣品的接收、登記、處理（如核酸提取、保存和加樣）等工作。此區域同樣應保持微正壓，并配備生物安全柜等設備，以確保操作人員的安全。該區域應符合生物安全二級標準，面積也在15~20平方米左右。

3. 核酸擴增區（擴增區）：是PCR實驗的核心區域，用于DNA擴增等實驗操作。此區域應保持微負壓，以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品。面積通常在15~20平方米左右。

4. 產物分析區（擴增產物分析區）：用于擴增產物的測定、結果分析、登記及報告等工作。此區域同樣應保持微負壓，并配備相應的分析儀器和設備。